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技术服务 >服务专题 >非编码RNA研究 >环状RNA研究
环状RNA研究

简介:

环状RNA (circRNA)是一类不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码 RNA 分子。 环状RNA (circRNA) 是区别于传统线性 RNA 的一类新型 RNA,大量存在于真核转录组中且表达具有时空特异性。在调控基因转录、作为疾病诊断marker等方面具有重要的研究和临床意义。 


吉满服务:

环状RNA过表达服务

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环状的RNA主要特征:

(1)circRNA由特殊的可变剪切产生,大量存在于真核细胞的细胞质中,但少部分内含子来源的circRNA则存在于核酸内,具有一定的组织、时序和疾病特异性;

(2)广泛存在于人体细胞中,有时甚至超过它们线性异构体的10倍之多;

(3)与传统的线型RNA不同,circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定;

(4)具有高度保守性,部分具有快速的进化性改变;

(5)大多数来源于外显子,少部分由内含子直接环化形成;

(6)可以翻译成蛋白质,但大部分是非编码RNA

 

环状RNA的主要类型:

环状RNA示意图 

Annot_exon:环状RNAbreakpoint位于已知基因的一个外显子的起始和另外一个外显子的终止,其序列由breakpoint之间的外显子的碱基构成。

One_exon:环状RNA位于已知基因的某一个外显子内,其序列由breakpoint之间的所有碱基构成。

Exon_intron:环状RNAbreakpoint之间有已知基因的一个或多个完成外显子但breakpoint不位于已知外显子的起始或终止,其序列由上breakpoint起始位点到第一个外显子起始位点、breakpoint之间的外显子和最后一个外显子到breakpoint终止位点的碱基构成。

Intronic:环状RNA位于已知基因的某一个内含子内,其序列由breakpoint之间的所有碱基构成。

Antisense:环状RNA位于已知基因的反义链,其序列由反义链上breakpoint之间的所有碱基构成。

Intergenic:环状RNA位于已知基因的之间,其序列由breakpoint之间的所有碱基构成。。

案例展示:




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