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龙华医院脾胃病研究所 从DNA甲基化水平揭示进展期腺瘤向结直肠癌的转变机制
吉满生物
2024-10-12

研究背景


根据最新的全球癌症数据统计分析,结直肠癌(CRC)的患病率排名第三,其中进展期腺瘤(AA)向结直肠癌(CRC)发生成为一种高危因素,已知5-甲基胞嘧啶(5-mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)在结直肠癌中起主要作用,但5-mC和5-hmC在AA-CRC转化中的作用尚不清楚。


文献来源


今年2月,上海中医药大学附属龙华医院季光课题组等人在Clinical and Translational Medicine期刊中,发表研究性论文“Dynamic changes in DNA methylation and hydroxymethylation revealed the transformation of advanced adenoma into colorectal carcinoma”,该研究揭示了5-mC 和 5-hmC在 AA-CRC中的转化机制。



项目研究


研究团队从临床样本出发,通过DNA甲基化测序鉴定出差异甲基化基因及位点,并分析了腺瘤和结直肠癌组织中5-mC的表达水平以及与总生存期之间的关系,结果显示AA中5-mC水平降低,CRC中5-mC水平升高,且与总生存期成负相关,分析CRC中5-hmC水平是降低的,但与总生存期不存在相关性。


Figure1.  在腺瘤和结直肠癌中证实了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶水平的动态变化


DNA甲基化是一种动态过程,在DNA去甲基化酶的作用下进行脱甲基,生成DNA羟甲基化及其他形式。


为了阐明CRC炎癌转化机制,进一步测定DNA甲基化酶DNMT3B和去甲基化酶TET2 的水平,发现DNMT3B水平显著升高,TET2 水平显著降低,这种变化趋势促进了CRC的发展;经sh-DNMT3B和TET2-OE处理后结果相反,起到抑制作用。


结合数据库分析,研究人员筛选出与CRC患者的总生存期呈负相关的基因,其中PPARGC1A基因5-mC水平显著升高,5-hmC水平显著降低。也就是说,DNMT3B和TET2介导的PPARGC1A甲基化动态变化可以调节AA-CRC转化。


Figure2.  DNMT3B和TET2通过介导PPARGC1A的5-mC和5-hmC来调节结直肠癌的进展


综上所述,5-mC和5-hmC在AA-CRC转化中存在动态变化。在机制上,DNMT3B介导的5-mC和TET2介导的5-hmC调控PPARGC1A的表达,从而调控AA-CRC转化的进程。此次研究结果不仅表明了DNMT3B 和 TET2 在 AA-CRC 转化中的关键作用,而且还为 CRC 治疗提供了新策略。


吉满助力


本研究中所用PPARGC1A过表达质粒和DNMT3B干扰质粒由吉满生物提供。

如想了解更多质粒构建,病毒包装,稳转株构建,敲除细胞株,报告基因检测等相关服务。欢迎访问吉满生物官网:www.genomeditech.com

免费咨询电话:400-627-9288




原文下载链接:doi: 10.1002/ctm2.1202

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龙华医院脾胃病研究所 从DNA甲基化水平揭示进展期腺瘤向结直肠癌的转变机制
吉满生物
2024-10-12

研究背景


根据最新的全球癌症数据统计分析,结直肠癌(CRC)的患病率排名第三,其中进展期腺瘤(AA)向结直肠癌(CRC)发生成为一种高危因素,已知5-甲基胞嘧啶(5-mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)在结直肠癌中起主要作用,但5-mC和5-hmC在AA-CRC转化中的作用尚不清楚。


文献来源


今年2月,上海中医药大学附属龙华医院季光课题组等人在Clinical and Translational Medicine期刊中,发表研究性论文“Dynamic changes in DNA methylation and hydroxymethylation revealed the transformation of advanced adenoma into colorectal carcinoma”,该研究揭示了5-mC 和 5-hmC在 AA-CRC中的转化机制。



项目研究


研究团队从临床样本出发,通过DNA甲基化测序鉴定出差异甲基化基因及位点,并分析了腺瘤和结直肠癌组织中5-mC的表达水平以及与总生存期之间的关系,结果显示AA中5-mC水平降低,CRC中5-mC水平升高,且与总生存期成负相关,分析CRC中5-hmC水平是降低的,但与总生存期不存在相关性。


Figure1.  在腺瘤和结直肠癌中证实了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶水平的动态变化


DNA甲基化是一种动态过程,在DNA去甲基化酶的作用下进行脱甲基,生成DNA羟甲基化及其他形式。


为了阐明CRC炎癌转化机制,进一步测定DNA甲基化酶DNMT3B和去甲基化酶TET2 的水平,发现DNMT3B水平显著升高,TET2 水平显著降低,这种变化趋势促进了CRC的发展;经sh-DNMT3B和TET2-OE处理后结果相反,起到抑制作用。


结合数据库分析,研究人员筛选出与CRC患者的总生存期呈负相关的基因,其中PPARGC1A基因5-mC水平显著升高,5-hmC水平显著降低。也就是说,DNMT3B和TET2介导的PPARGC1A甲基化动态变化可以调节AA-CRC转化。


Figure2.  DNMT3B和TET2通过介导PPARGC1A的5-mC和5-hmC来调节结直肠癌的进展


综上所述,5-mC和5-hmC在AA-CRC转化中存在动态变化。在机制上,DNMT3B介导的5-mC和TET2介导的5-hmC调控PPARGC1A的表达,从而调控AA-CRC转化的进程。此次研究结果不仅表明了DNMT3B 和 TET2 在 AA-CRC 转化中的关键作用,而且还为 CRC 治疗提供了新策略。


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本研究中所用PPARGC1A过表达质粒和DNMT3B干扰质粒由吉满生物提供。

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